中国社会科学院日本研究所经国务院批准于 1981年 5月成立，是中国社会科学院下属的专门从事当代日本问题研究的学术机构和智库单位。
一、研究任务与职能
日本研究所以马克思主义理论为指导，坚持正确的政治方向和学术导向，努力推动构建有中国特色的日本研究学科体系、学术体系和话语体系。日本研究所坚持基础理论研究和应用政策研究相结合，以学科为基础、以问题为导向，在推动学科建设、学术创新的同时，努力回应国家经济社会发展与对外战略政策的需要，承担并完成了多项国家级、省部级研究课题以及国内外合作研究项目，推出了一大批高质量科研成果，奠定了日本政治、经济、外交、社会、文化、战略及中日关系研究的学科基础及全国当代日本问题研究的领军地位。
二、机构设置与人员编制
根据上述职责，中国社会科学院日本研究所内设 10 个机构，分别为办公室、科研处、日本政治研究室、日本经济研究室、日本外交研究室、日本社会文化研究室、日本历史研究室、综合战略研究室、《日本学刊》编辑部、网络资料室。
研究所管理一个院级非实体研究中心即东海问题研究中心，四个所级非实体研究中心即日本政治研究中心、中日关系研究中心、中日经济研究中心、中日社会文化研究中心，代管两个全国性日本研究学术社团即中华日本学会、全国日本经济学会。
三、主要成果与出版物
日本研究所的主要科研成果形式是学术专著、论文、政策研究报告、教材和翻译作品等。建所以来共出版学术著作和工具书近400部、译著100余部、学术论文约2000篇以及大量政策研究报告，承担完成多项国家级、省部级研究课题，培养并向全国输送了200余名硕士、博士毕业生。
研究所主办两本刊物（《日本学刊》《日本文论》）、两部蓝皮书（《日本蓝皮书》《日本经济蓝皮书》）、一部学术年鉴（《中国日本研究年鉴》）。这些载体均已成为国内外了解中国当代日本研究学术前沿及最新研究成果的重要窗口。
四、国际学术交流与合作
日本研究所与国内多家单位及日本、美国、韩国、东南亚等多个国家的学术团体、智库高校、政府机构及新闻媒体等保持着交流关系，在学术信息共享、联合研究、联合办会等方面进行了大量富有成效的合作。研究所每年利用各种形式派出多批次团组出国调研、访学或参会，定期或不定期举办国际学术研讨会，邀请众多日本及国际知名政要、专家学者出席。
五、硕博研究生教育培养
研究所承担中国社会科学院研究生院日本研究系职责，招收培养当代日本研究的硕士生和博士生，具有国际关系、国际政治、世界经济专业的硕博学位授予权；设有博士后流动站，为中国的当代日本研究领域培养和输送后备人才。
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